生物菌肥根據其作用不同，可分為以下5類：

1、有固氮作用的菌肥：包括根瘤菌、固氮菌、固氮藍藻等；

2、分解土壤有機物的菌肥：包括有機磷細菌和復合細菌等；

3、分解土壤中難溶性礦物的菌肥：包括硅酸鹽細菌、無機磷細菌等；

4、促進作物對土壤養(yǎng)分利用的菌肥：包括菌根菌等；

5、抗病及刺激作物生長的菌肥：包括抗生菌、增產菌等。

24種菌的作用盤點

1、枯草芽孢桿菌：增加作物抗逆性、固氮。

2、地衣芽孢桿菌：抗病、殺滅有害菌。

3、解淀粉芽孢桿菌：分泌抗菌物質，產生拮抗作用，營養(yǎng)與空間的競爭，誘導寄主產生抗性和促進植物生長。

4、巨大芽孢桿菌：解磷（磷細菌），具有很好的降解土壤中有機磷的功效。

5、膠凍樣芽孢桿菌：解鉀，釋放出可溶磷鉀元素及鈣、硫、鎂、鐵、鋅、鉬、錳等中微量元素。

6、側孢芽孢桿菌：促根、殺菌及降解重金屬。

7、膠質芽孢桿菌：有溶磷、釋鉀和固氮功能，分泌多種酶，增強作物對一些病害的抵抗力。

8、涇陽鏈霉菌：具有增強土壤肥力、刺激作物生長的能力。

9、菌根真菌：擴大根系吸收面，增加對原根毛吸收范圍外的元素（特別是磷）的吸收能力。

10、棕色固氮菌：固定空氣中的游離氮，增產。

11、圓褐固氮菌：固氮、提高作物產量。

12、放線菌：拮抗病原菌防病壯菌的作用，分泌細胞分裂素促進作物的生長。

13、光合菌群：合成糖類、氨基酸類、維生素類、氮素化合物、抗病毒物質和生理活性物質等，是肥沃土壤和促進動植物生長的主力部隊。

14、乳酸菌群：具有很強的殺菌能力，能有效抑制有害微生物的活動和有機物的急劇腐敗分解，能夠分解在常態(tài)下不易分解的木質素和纖維素，并使有機物發(fā)酵分解。乳酸菌還能夠抑制連作障礙產生的致病菌增殖。

15、酵母菌群：合成促進根系生長及細胞分裂的活性化物質，促進其它有效微生物增殖所需要的基質（食物）提供重要的給養(yǎng)保障。

16、凝結芽孢桿菌：可降低環(huán)境中的氨氣、硫化氫等有害氣體。提高果實中氨基酸的含量。

17、米曲霉：使秸稈中的有機質成為植物生長所需的營養(yǎng)，提高土壤有機質，改善土壤結構。分解蛋白質、纖維素、半纖維素、木質素等，并將嗜熱、耐熱細菌、真菌、酵母菌菌株及相關分解酶復合而成，降解能力強，同時能夠達到升溫、除臭、消除病蟲害、雜草種子和提高養(yǎng)分的效果。

18、黑曲霉：裂解大分子有機物和難溶無機物，便于作物吸收利用，改善土壤結構，增強土壤肥力，提高作物產量。

19、綠色木霉：是所產纖維素酶活性最高的菌株之一，所產生的纖維素酶對作物有降解作用，效果非常好，同時又是一種資源豐富的拮抗微生物，具有保護和治療雙重功效，可有效防治土傳性病害。

20、哈茨木霉：用來預防由腐霉菌、立枯絲核菌、鐮刀菌、黑根霉、柱孢霉、核盤菌、齊整小核菌等病原菌引起的植物病害。

21、淡紫擬青霉：對多種線蟲都有防治效能，是防治根結線蟲最有前途的生防制劑。

22、白僵菌：在自然條件通過體壁接觸感染殺死害蟲。

23、綠僵菌：能夠寄生于多種害蟲的一類殺蟲真菌，通過體表入侵作用進入害蟲體內，在害蟲體內不斷增繁殖通過消耗營養(yǎng)、機械穿透、產生毒素，并不斷在害蟲種群中傳播，使害蟲致死。

24、EM菌：由雙岐菌、乳酸菌、芽孢桿菌（地衣芽孢桿菌、枯草芽孢桿菌、膠質芽孢桿菌、蘇云金芽孢桿菌等）、光合細菌、酵母菌、放線菌、醋酸菌等單一菌種經特殊工藝單獨擴培、發(fā)酵、噴霧干燥而成的高效復合微生物菌種。