因地制宜對(duì)含硫高的土壤和銹水田，不宜施用生物菌肥，因?yàn)榱蚰軞⑺郎锞?。?duì)于翻漿的水田，一般不撒施，用噴霧的方法效果更明顯。

　　因溫制宜施用菌肥的最佳溫度是25℃～37℃，低于5℃或高于45℃，施用效果較差。對(duì)高溫、低溫、干旱條件下的農(nóng)作物田塊不宜施用。

　　因混制宜不可將菌肥與殺菌劑、殺蟲(chóng)劑、除草劑和含硫的化肥（如硫酸鉀等）以及稻草灰混合施用，因?yàn)檫@些藥、肥容易殺死生物菌?？上仁┚?，隔48小時(shí)后，再打藥除草。若拌種，切忌和已拌好殺菌劑的種子混合用。還應(yīng)防止與未腐熟農(nóng)家肥混用。

　　因量制宜對(duì)于多年來(lái)施用化肥的田塊，施用生物菌肥時(shí)不能大量減施化肥和有機(jī)肥，因農(nóng)作物對(duì)化肥產(chǎn)生了依賴性，用生物菌肥取代氮肥不能一下子適應(yīng)。因此，其取代量應(yīng)做到第一、第二、第三年分別取代30％、40％和60％，磷、鉀肥只能補(bǔ)足，不能減少。

　　因時(shí)制宜生物菌肥不是速效肥，在作物的營(yíng)養(yǎng)臨界期和營(yíng)養(yǎng)大量吸收期前7～10天施用，效果最佳。